艾条在烧的时候产生烟。“吸烟有害健康”，这已经是公认的常识了。那么艾烟也是烟，会不会对人体产生不利的影响呢？ 在有关艾灸的很多书里边，或者一些学术之间的讨论，这个问题也是个焦点。艾烟到底对人好不好？它里面有没有一些有毒的东西，比如说一氧化碳之类的？这个是难免的。毕竟它在燃烧的过程中不可能完全燃烧。但是艾烟又不同于一般的烟，现代研究者曾做过一个实验，用艾烟熏病毒、真菌，结果五十分钟左右，这些病菌，病毒基本上都会被杀死，可见艾烟有很多的抑制病毒的作用，从而减少疾病的传播。在古代，人们就认为这是辟邪。 有人认为艾烟发呛，其实艾烟就是艾的应用之一。古人就有艾叶烟熏治疗和预防疾病的习惯，而且这种习惯一直延续至今，民间认为艾叶燃烧产生的烟有预防、辟邪（瘟疫）的作用。
现代研究则证明艾烟有预防疾病瘟疫的作用，因为艾烟对引起不同传染性、流行性疾病的多种致病菌、真菌和病毒的都有抑制作用。而在传染性非典型肺炎流行之际有医学专家提出运用艾条燃烧的烟进行空气消毒预防，也是有一定科学道理的。而且艾烟还具有很好的平喘镇咳作用。 现在在农村里边，妇女生了孩子后，在她回家之前，家里边往往会用艾烟熏一下。这在古代来讲是辟邪的，现在来说的话，就是消毒杀菌，而且它几乎可以杀灭各种各样的细菌。 现在买艾非常方便，作为家庭消毒的话，就不需要特意用艾柱了，如果使用艾柱灭菌比较浪费，用艾条就可以了。把屋里边熏一熏，或者家里边有感冒了，怕发生交叉感染，也可以点燃艾香来熏一熏屋子。艾烟也不是越大越好，一般控制在你能够接受的范围内就可以了。 每到季节变化，正是病菌繁殖活跃期，如果此时用熏艾灭菌，对抑制病毒繁殖和感染都会有一定的效果。